前回(2018-12-12)の記事：
「
Anaconda 学習：MayaVi 導入」の後、
あれこれ
MayaVi を学習していたが、・・・・・
こんな記事に辿り着いた：StackOverflow の、
「
Plot 2d line diagram in mayavi」
質問は、
I have a dataset of a tennis game.
This dataset contains the ball positions in each rally
and the current score.
I already 3d-visualized the game and ball positions in mayavi.
Now I want to plot 2d line diagrams in mayavi that
visualizes the score developement after specific events
(such as after: a break, a set-win, set-loss,...).
I came up with some ideas, but none of them are satisfying:
・I could use imshow and "draw" the diagram
・I could use points3d to plot the diagram
・Maybe I can somehow use pyplot to plot the diagram,
then make a screenshot und then plot this screenshot in mayavi...
Any idea if this is possible?
Do you have any other idea how I could plot a 2d line diagram in mayavi?
＝＝＝
私はテニスゲームのデータセットを持っています。
このデータセットには、各ラリーのボールの位置と
現在のスコアが含まれています。
私はすでにmayaviのゲームとボールの位置を3D視覚化しました。
今、私は、特定のイベント（例えば、休憩、セットウィン、セットロスなど）
後にスコアの変化を視覚化する2次元線図をmayaviに
プロットする必要があります。
私はいくつかのアイデアを思いついたが、どれも満足できるものではなかった：
・私はimshowを使用してダイアグラムを描画することができます
・私は図をプロットするためにポイント3Dを使用することができます
・たぶん私は何とかダイアプロットをプロットするためにパイロットを使用し、
次にスクリーンショットを作り、
mayaviでこのスクリーンショットをプロットすることができます。
どのようにmayaviの2d線図をプロットすることができる他の考えがありますか？
それで、回答は：
Mayavi is not really good at plotting 2d-diagramms,
you can cheat a little by setting your camera position parallel
to an 2d image.
If you want to plot 2d-diagramms try using matplotlib.
＝＝＝
Mayaviは2次元図をプロットするのにうまくいかないので、
カメラの位置を2次元画像と平行に設定することで、
ちょっと騙すことができます。
2Dチャートをプロットしたい場合は、matplotlibを使ってみてください。
と言うことですネ。
これは残念ダ。( matplotlib の代わりにはならない？ )
ここで、あれこれ検索していた。
「vtk、numpy、MayaVi」等々で。
Stack Overflow の、
「
Reading a .vtk file with python」
を見つけた。
質問は、
書き出しは 「PyEVTK」を使うが、読み込みは？？？
と言うこと？
それで、
回答は６つ。(以下キーワードのみ)
回答[13]：Here is the solution that I came up with,
the trick was turning on ReadAllVectorsOn().
import numpy
from vtk import vtkStructuredPointsReader
from vtk.util import numpy_support as VN
回答[6]：Here's a script that reads polygon data into numpy arrays from
a VTK file using the VTK Python SDK:
import sys
import numpy
import vtk
回答[5]：
meshio (a project of mine) knows the VTK format, so you could simply
pip install meshio
and then
import meshio
mesh = meshio.read('file.vtk')
回答[4]：Have you tried using paraview? (http://www.paraview.org/)
It can give you a visual idea of what is going on behind the scenes
and can output the file in a number of different ways.
I would suggest this as I don't have a clue what your data is like.
http://www.vtk.org/Wiki/VTK/・・・ may also have an example
that may fit the bill for you. Personally,
I'd have a play with paraview and go from there.
回答[4]：It should be mentioned that in its latest release,
the yt project
http://yt-project.org/ includes support for ATHENA,
meaning that by all means
this is way to analyze the simulation data using python.
回答[0]：vtkGenericDataObjectReader()
省略
この内の、回答[4](２つ目)
「
yt」に注目した。
yt is an open-source, permissively-licensed python package
for analyzing and visualizing volumetric data.
yt supports structured, variable-resolution meshes, unstructured meshes,
and discrete or sampled data such as particles.
Focused on driving physically-meaningful inquiry,
yt has been applied in domains such as astrophysics, seismology,
nuclear engineering, molecular dynamics, and oceanography.
Composed of a friendly community of users and developers,
we want to make it easy to use and develop -
we'd love it if you got involved!
＝＝＝
ytは、ボリュームデータを解析して可視化するための、
オープンソースの許可されたPythonパッケージです。
構造化可変解像度メッシュ、非構造メッシュ、パーティクルなどの離散または
サンプリングされたデータをサポートします。
物理的に意味のある探求を推進することに重点を置いて、
ytは天体物理学、地震学、原子力工学、分子動力学、海洋学などの
分野で応用されてきました。
フレンドリーなユーザーと開発者のコミュニティで構成されており、
使いやすく開発したいと考えています。
それで、
Get yt: using conda.
ですネ。
If you use the anaconda python distribution or use conda
to manage python packages,
you can install the latest stable version of yt
with the following command:
＝＝＝
pythonパッケージを管理するためにanaconda python
ディストリビューションを使用するか
condaを使用する場合は、
次のコマンドを使用して最新の安定版ytをインストールできます。
$ conda install -c conda-forge yt
ytなんて単純な名前だと
Anaconda Cloud で見つけるのは苦労しましたが、
なんとか見つけられました：
「
conda-forge / packages / yt 3.5.0」
ですね。
サンプルコードは、
「
Cookbook」にありますネ。
中には、
「
Simple 1D Line Plotting」
This script shows how to make a LinePlot through a dataset.
See Line Plots for more information.
(simple_1d_line_plot.py)
import yt
ds = yt.load('・・・', step=-1)
plot = yt.LinePlot(ds, [('all', 'v'), ('all', 'u')], ・・・)
plot.annotate_legend(('all', 'v'))
plot.save()
なんかがある。
導入を考えようかナ？
本日はここまで。
Anaconda ( Python ) 学習は続く。
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