物質DBサイト一覧改

2009-12-23 :  理科部 部活
ご訪問ありがとうございます。


物質DBサイト一覧」を若干加筆しました。

物質を構成する原子の座標データが得られるか? ファイル形式は何か?
に注目して、情報を追記しました。

                                         <順不同>
************************************
サイト名 : 一言
      ・・・・・・・・・・ 記載した記事
------------------------------------
ICSD : 英語。構成原子で(結晶)検索。要ユーザー登録(無料)
      ICSD版Jmol 表示。 CIF
      ・・・・・・・・・・ 「改訂版ICSD」「ICSD で 霰石 検索」「大本山:JAICI」

ZINC : 英語。JMEエディタで描画/SMILESで検索
      Jmol 表示。 Smiles(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「ZINC:化合物DB」

C@ROL : 英語。JMEエディタで描画/名称/化学式で検索
      Jmol 表示(CORINAで3D化済)。 Smiles(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「検索サイト:C@ROL」

産総研:RIO-DB : 日本語。一覧から選択(鉱物、化学)
      結晶構造:CIF
      鉱物:画像(写真)表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 「産総研:RIO-DB」

PubChem : 英語。名称/化学式で検索
      PNG 画像表示。 2D SDF
      ・・・・・・・・・・ 「検索サイト:PubChem」

3DMET : 英語。名称/化学式で検索
      Jmol 表示。 InCHI、Smiles(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「検索サイト:3DMET」

Common Compound Library : 英語。名称/化学式で検索
      Chime 表示。 PDB、MDL
      ・・・・・・・・・・ 「化学式による検索3」

日本化学物質辞書Web : 日本語。名称/化学式で検索
      MOLFile(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「検索サイト:日化辞Web」

ChemBioFinder.com : 英語。名称/化学式で検索
      InCHI、Smiles(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「化学式による検索2」

Search for Species Data by Chemical Formula : 英語。化学式で検索
      Inchi(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「化学式による検索」

COMPOUND database : 英語。名称で検索
      Jmol 表示。 mol(2D構造)
      ・・・・・・・・・・ 「3DMET の元 COMPOUND DB」

ChemIDplus : 英語。名称で検索
      MarvinView 表示。 mol
      ・・・・・・・・・・ 「検索サイト:ChemIDplus」

molecules alphabetically : 英語。一覧から選択
      Chime 表示。 PDB、MDL
      ・・・・・・・・・・ 「分子構造DBサイト」

ATHENA MINERALOGY : 英語。名称で検索/一覧から選択(無機物)
      画像(写真)表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 『ATHENA』

Crystal Lattice Structures : 英語。解説/一覧から選択(結晶)
      XYZ
      ・・・・・・・・・・ 「Crystal_Lattice_Structures」

NIMS 物質・材料データベース : 英語。キーワードで検索(無機物)要ユーザー登録(無料)
      CIF
      ・・・・・・・・・・ 「NIMS 物質・材料データベース」

mindat.org : 英語。名称/産地で検索(鉱物)
      結晶構造表示。参照サイトで入手。
      ・・・・・・・・・・ 「鉱物 データベース サイト」

Mineralogy Database : 英語。名称/化学式で検索/一覧から選択(鉱物)
      jPOWD アプレット表示、組成式のみ。参照サイトで入手。
      ・・・・・・・・・・ 「鉱物 図鑑 ?」

AMCSD:American Mineralogist Crystal Structure Database : 英語。名称で検索(鉱物)
      Amc format、CIF
      ・・・・・・・・・・ 「AMCSD」

結晶構造ギャラリー : 日本語。一覧から選択
      GIF画像表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 「研究所一般公開 見学」

生活環境化学の部屋 : 日本語。一覧から選択
      Jmol 表示。 mol
      ・・・・・・・・・・ 『生活環境化学の部屋』

田中の Collectionroom : 日本語。一覧から選択(鉱物)
      画像(写真)表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 「日本語版 鉱物 図鑑3 後日談」

日本産鉱物展示館 : 日本語。一覧から選択(鉱物)
      画像(写真)表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 「日本語版 鉱物 図鑑2」

加藤の鉱物、化石コレクション : 日本語。一覧から選択(鉱物)
      画像(写真)表示のみ。
      ・・・・・・・・・・ 「日本語版 鉱物 図鑑」

VRML図鑑 VRMLを使用した動く図鑑 : 英語。一覧から選択(生物)(VRML)
      VRML 表示(CORTONA3D)
      ・・・・・・・・・・ 「VRML図鑑:動く図鑑」

The Virtual Museum of Minerals and Molecules(TM) : 英語。一覧から選択(鉱物)(教育用)
      Jmol 表示。 PDB
      ・・・・・・・・・・ 「VMMM」

Library of 3-D Molecular Structures : 英語。一覧から選択(教育用)
      PDB
      ・・・・・・・・・・ 「3-D Molecular Structures」

Teaching Database : 英語。一覧から選択(教育用サンプル)
      CSD-format database(Mercury のみ対応)
      ・・・・・・・・・・ 「教育用分子構造500」

************************************

何かの参考になりましたら、嬉しいです。       



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