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Jmol から JSmol

2014-01-17 :  PCクリニック
久しぶり、2012-05-13 以来でしょうか:
COD:Crystallography Open Database

  ・・・・・
  Crystallography(結晶学)に関するオープン(フリー)なデータベースですね。

  Open-access collection of crystal structures of organic, inorganic,
  metal-organic compounds and minerals, excluding biopolymers

  とある。

  有機、無機、有機金属化合物、鉱物の、結晶構造を、自由にアクセスできる。
  但し、biopolymers(生物高分子)を除く。
  それらは、「PDB(Protein Data Bank)」の方にある?
  ・・・・・

を覗いてみた。

中程に、
  Currently there are 252346 entries in the COD.
  Latest deposited structure: 9011297 on 2014-01-15 at 15:42:19 UTC
とあるので、リンクをクリックした。

構造データが表示されている。

が、何か変わっているような???

窓(?)の右下には、「JSmol」とあり、
この窓(?)のすぐ下に、「Display in Jmol
とある???
このリンクでは、エラー・・・
そう、「Java VM には問題がある」と云うことで、
アンインストールしていたのだった。


そうすると、「JSmol」って???

「Jmol」とは違うもの?


調べてみた。

お世話になっている、“木原先生”のページ:
JSmolに関する情報
が見つかった。

  JSmolは、分子の3次元分子構造の表示を行うJmol のHTML5 キャンバス版です。

  JSmol はJavaを利用しないため、HTML5をサポートするWebブラウザーであれば
  機種に関わらず利用することができます。

  ・・・・・

なにぃ!

HTML5/canvas を用いた「Jmol」???


これは!!!!!

「Jmol Wiki」に、
Jmol JavaScript Object
があった。

  2.1 Current limitations of JSmol

に、

  ・ Using local files (i.e. not in a web server) is not supported on
      some browsers due to their security policies
   ・ MSIE allows access to non-binary local files only
   ・ Opera allows no access to local files
   ・ Chrome allows access only when using a command-line flag
  ・ Opening binary files (e.g Spartan files, gzipped files,
      File icon.gifpngj files): they can be read,
      but must be identified as such in their file name (see below).
  ・ Writing of File icon.gifjpg, File icon.gifpng and File
      icon.gifpngj (png+zip) data is fully supported,
      but delivering it to a user may require a server-side piece.
      (See also Exporting an image for alternatives).
  ・ The Jmol prompt command does not allow more than a
      simple JavaScript-like response in the HTML5 version.
  ・ The WebGL modality of JSmol has not been fully developed and
      feature support is limited.

とある。

と云うことは、「Firefox」だと制限無し?


これは、導入するしかないナ。


頑張ってみます。


見ていただいた序でとは厚かましい限りですが、
お帰りに投票して頂けるとなお嬉しいです。 ⇒ blogram投票ボタン


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