Avogadro:Auto Optimization

2015-10-21 :  理科部 部活
本文の前に、
-・・・ -・-
現時点での blogramのランクインカテゴリは、
6、2、1、1、0、 0、0、0、0、0(41)で、換算ポイント 86pt 。
「Firefox」が5位にアップ、6位にダウン、そして4位にアップ。
「Perl」「化学業界」「硝子業界」「グルコサミン」、
「e-radio」「Python」「FM COCOLO」はbg値変動のみ。
「C言語」「FM青森」は全く変化無し。
・-・ - -・

さて、本文。

Avogadro Auto Optimization
と検索すると、

「YouTube」の動画:「Avogadro Auto Optimization
が見つかる。

動画の最初に出てくる、
スポットライトが当たっている「E」の様なボタンで指定できる。

これ、
適当な構造を作って、
「Start」ボタンで実行させると、

途中、
「指マーク(F10)」ボタンで、マウスドラッグでも即時反応し、

また、
「鉛筆マーク(F8)」ボタンで、Atomを追加/削除させても即時反応する。

なかなか面白い機能だ。


一通り見終わったので、・・・・・

右に目を移すと、
Avogadro: Geometry optimizations」なんて
のもある。



最初の検索に戻ると、・・・・・

他に、
Molecular Modeling Basics
と云ったブログがある。

此によると、複数の“水分子”でも行ける!!


で、本家マニュアル:
AutoOptimization Tool
があった。



更には、
“www.ncbi.nlm.nih.gov”の、
“PubMed Central (PMC)”の「PMC3542060」:
Avogadro: ・・・ editor, visualization, and analysis platform
これは一読の価値があるものだ。


本日はここまで。


見ていただいた序でとは厚かましい限りですが、
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