ImageJ 学習:vtkファイルは?

2016-11-14 :  PCクリニック
Python、C言語、Perl、グルコサミン、Firefox
あれこれ ImageJ を学習していて、
ふと、
vtk”ファイルは読めないのか?
と思った。

「ImageJ vtk」で検索してみた。


トップで見つかったのは:“IJ Plugins”の、
ij-VTK: the Visualization ToolKit for ImageJ
ですが、
これは正にプラグインはなし.

知りたいのは、“vtk”ファイルのコト。

そのものずばりのQ&Aが見つかった:“ImageJ Forum”の、
Does ImageJ support VTK file - Image Analysis

質問は:
  Does ImageJ support VTK file ? I have Heart Atlas (VTK format) and
  another Heart data with Deformities (DICOM file).
  I want to do 3D registration for image Alignment.
  I don't know how to do it. Please guide me.
===
  ImageJ は、VTK ファイルをサポートして?心臓アトラス (VTK 形式)、
  変形 (DICOM ファイル) を別の心のデータがあります。
  画像配置の 3 D の登録をしたいです。
  私はどのようにそれを知らない。私を導いてください。
???

それで、回答(Bio7) は、
  Eventually as a workaround you can try paraview:
    http://www.paraview.org/5
  And then save the file to an *x3d file which can be opened again
  with Blender and exported with Blender to an *.obj file for
  the import in the ImageJ 3D viewer:
===
  回避策として最終的に paraview を試すことができます:
    http://www.paraview.org/5
  にファイルを保存する * x3d ファイルをミキサーで再度開き、
  ミキサーで ImageJ の 3 D ビューアーでインポート *.obj ファイルに
  エクスポートすることができます。
???

つまり、

先ず、“ParaView”で vtkファイルを、x3d形式に変換し、
それを、“Blender”で obj形式に変換する。
そうすると、
この“*.obj”ファイルはImageJで読み込める。

と云うことですネ。


ImageJを立ち上げてみた。

「Plugins」メニューの
「3D」→「3D Viewer」を開くと、
「File」メニューがあって、
2番目の“Import Surfaces”に、

  “WaveFront”
  “STL”

がある。(WaveFront は obj のコト?)

1番目の“Open”メニューではダメ。


あれこれ、
手持ちのファイルを読み込んでみた。

「.obj」ファイルでは、読めたり読めなかったり。

「.stl」ファイルは、ASCII テキストでもバイナリでも読み込めた。

尚、「.obj」ファイルは、ASCII テキストであって、
( これに対応するバイナリファイルは、「.mod」??? )


結論:ImageJ では、
(プラグイン無しでは) vtk ファイルは読めない?
でも、代わり(?)に STL ファイルを読める。


更に、
「File」メニューの
3番目の“Export Surfaces”は注目すべきダ。


本日はここまで。


ImageJ 学習は続く。


見ていただいた序でとは厚かましい限りですが、
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