mol2 の Du はネオ元素では無い！

2019-01-23 ：  理科部 部活

以前(2018-10-24)の記事「Du：ネオ元素」は、
勘違いから記事にしたものだった。


別件の作業から、・・・・・

改めて .mol2 (Sybyl Mol2 format)形式について調べていたら、

「Working with MOL2 Structures in DataFrames」
を見つけた。

このページを読み(？)進めていたら、

　　A list of all the allowed atom types that can be found in
　　Tripos MOL2 files is provided below:
＝＝＝
　　Tripos MOL2ファイルで見つかることができるすべての許容された
　　原子タイプのリストは以下に提供されます：
？？？

と云うことで、

中に

　　・・・・・・・・・・・
　　・・・・・・・・・・・
　　Du　　　dummy atom
　　Du.C　　dummy carbon
　　Any　　 any atom
　　Hal　　 halogen
　　・・・・・・・・・・・
　　・・・・・・・・・・・


と有った！！！



「Materials Studio」
では、

1 Ag1 -1.82334 -0.00025 0.00000 Du 0 **** 0

の様に Du が現れるが、


「OpenBabel」
では、

      1 AG         -1.8233   -0.0003    0.0000 Ag      1  UNL1        0.0000

とキチン(？)と出力されている。



ネオ元素なんて別世界のものではなかった。



本日はここまで。


化学(？)の学習は続く。


見ていただいた序でとは厚かましい限りですが、
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