検索サイト:3DMET

2009-10-15 :  理科部 部活
ご訪問ありがとうございます。


前回の「ChemIDplus」は米国の公的機関のデータベースでした。
今度の「3DMET」は、日本(?)の公的機関(?)のデータベースのようです。


  3DMET is a database collecting three-dimensional
  structures of natural metabolites.
つまり、
  3DMET は、天然の代謝物の三次元構造を集めたデータベースです。
と云うことでしょうか?






「ChemIDplus」では、ginkgoliteの3D構造が「MarvinView」で見られました。


「3DMET」でも検索してみます。







結果はJmol Applet での表示です。




こっちの方が、「Jmol」表示だから良いか?
でも、5920件しか(?)無いようですが、・・・・・


と云うことで、今日の 部活動 は終了です。     



見ていただきありがとうございました。
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No title

3DMETの開発者です。

とりあげていただきありがとうございました。

release 2.1が出ましたので、古い画面等更新していただければと思います。

他の関連のところも読みましたが、SMILESは二次元だけの表記ではないのと一意性がないわけでもないですよ。(^^)

3DMET作成者 さんへ

古い記事を見つけて頂き、感謝いたします。
開発者様、恐れ入ります。
また、
「SMILES」について、「二次元だけの表記ではない」「一意性がないわけでもない」
とのご指摘、承りました。
また、「release 2.1」につきましては、
近いうちに記事にしたいと存じます。

素人の私が云うのもなんなんですが、
使用されている「Jmol」は11.4.5のようですね。
12.0.RC26以降(J-ICEが使っているのは12.3.4のようですが)にupされては如何でしょうか?

今後とも、宜しくお願い致します。

No title

Jmolのアップデートやってもいいのですが、このweb上で必要な機能は三次元構造の表示だけなので、あえてアップデートする必要はないかなと思っています。
表示に問題が出るとかいうようなリクエストが出たらアップデートするかもです。

3DMET作成者 さんへ

失礼しました。
余計なお節介を焼いてしまいました。
此に懲りずに、ご贔屓に願います。
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